Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r58G3X9U3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r58G3X9U3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vmn1r58G3X9U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms