Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnmal2G3X9N3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pnmal2G3X9N3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pnmal2G3X9N3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnmal2G3X9N3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnmal2G3X9N3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms