Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm8220F6YKI2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm8220F6YKI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms