Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Igkv1-99F6XWB2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-99F6XWB2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-99F6XWB2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms