Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl3d2F6R3P9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prl3d2F6R3P9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prl3d2F6R3P9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prl3d2F6R3P9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prl3d2F6R3P9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms