Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Svs3aF2Z472 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Svs3aF2Z472 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Svs3aF2Z472 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Svs3aF2Z472 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms