Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930451I11RikE9Q9R3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4930451I11RikE9Q9R3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930451I11RikE9Q9R3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms