Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh18E9Q9Q6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh18E9Q9Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh18E9Q9Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms