Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer4f2E9Q366 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer4f2E9Q366 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f2E9Q366 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f2E9Q366 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms