Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt90E9Q1Z0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt90E9Q1Z0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt90E9Q1Z0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186 ms