Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r68E9Q0V3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vmn1r68E9Q0V3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r68E9Q0V3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms