Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm20425E9Q035 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm20425E9Q035 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm20425E9Q035 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm20425E9Q035 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms