Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpl3lE9PWZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpl3lE9PWZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpl3lE9PWZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327.8 ms