Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl3E0CZ16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl3E0CZ16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl3E0CZ16 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms