Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
1110002E22RikE0CYV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1110002E22RikE0CYV9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1110002E22RikE0CYV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1110002E22RikE0CYV9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1110002E22RikE0CYV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms