Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700015F17RikD3YUK8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700015F17RikD3YUK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700015F17RikD3YUK8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms