Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rfx8D3YU81 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx8D3YU81 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx8D3YU81 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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