Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna7C0LLJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kpna7C0LLJ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kpna7C0LLJ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kpna7C0LLJ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms