Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FanceB8JJD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FanceB8JJD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanceB8JJD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanceB8JJD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms