Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp26c1B2RXA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyp26c1B2RXA7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp26c1B2RXA7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp26c1B2RXA7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms