Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc22a28B2RT89 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc22a28B2RT89 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc22a28B2RT89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms