Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ythdc2B2RR83 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ythdc2B2RR83 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ythdc2B2RR83 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ythdc2B2RR83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
Ythdc2B2RR83 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ythdc2B2RR83 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms