Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brpf3B2KF05 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf3B2KF05 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf3B2KF05 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf3B2KF05 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf3B2KF05 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms