Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zfp40B1B1D3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp40B1B1D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp40B1B1D3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp40B1B1D3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp40B1B1D3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms