Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NhsB1AV60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NhsB1AV60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NhsB1AV60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NhsB1AV60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
NhsB1AV60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NhsB1AV60 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms