Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PtpruB1AUH1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PtpruB1AUH1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PtpruB1AUH1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PtpruB1AUH1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtpruB1AUH1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtpruB1AUH1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms