Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms