Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Skint2A7XUX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Skint2A7XUX6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Skint2A7XUX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms