Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2c2A7L9Z8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2c2A7L9Z8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp2c2A7L9Z8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2c2A7L9Z8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms