Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prss40A6H6T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prss40A6H6T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prss40A6H6T1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms