Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trmt1lA2RSY6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt1lA2RSY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt1lA2RSY6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1lA2RSY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms