Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Pramef17A2ASJ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramef17A2ASJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef17A2ASJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef17A2ASJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramef17A2ASJ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms