Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chd5A2A8L1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chd5A2A8L1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Chd5A2A8L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chd5A2A8L1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms