Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pabpc1lA2A5N3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pabpc1lA2A5N3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pabpc1lA2A5N3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pabpc1lA2A5N3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms