Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cc2d2bA0A286YDU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.34
Cc2d2bA0A286YDU8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Cc2d2bA0A286YDU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cc2d2bA0A286YDU8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms