Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCH8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A286YCH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YCH8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YCH8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A286YCH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms