Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28171A0A087WQ19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28171A0A087WQ19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Gm28171A0A087WQ19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28171A0A087WQ19 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Gm28171A0A087WQ19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28171A0A087WQ19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28171A0A087WQ19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Gm28171A0A087WQ19 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Gm28171A0A087WQ19 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28171A0A087WQ19 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm28171A0A087WQ19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28171A0A087WQ19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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