Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kif3aP28741 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms