Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kif3aP28741 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms