Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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