Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif3aP28741 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms