Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb3P09026 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb3P09026 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms