Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt27Q9Z320 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt27Q9Z320 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt27Q9Z320 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt27Q9Z320 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms