Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdpk1Q9Z2A0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms