Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne2Q9Z238 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne2Q9Z238 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccne2Q9Z238 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccne2Q9Z238 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms