Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bgrQ9WUZ7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms