Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uchl5Q9WUP7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Uchl5Q9WUP7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uchl5Q9WUP7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Uchl5Q9WUP7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 849.9 ms