Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited4Q9WUL8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited4Q9WUL8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms