Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcsQ9WU84 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CcsQ9WU84 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CcsQ9WU84 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms