Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb3Q9R1P1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb3Q9R1P1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms