Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AmfrQ9R049 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AmfrQ9R049 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AmfrQ9R049 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AmfrQ9R049 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms